實驗室通風柜的結構是上下的，頂部有排氣孔，可以安裝風扇。
上柜配有導流板、電路控制觸摸開關、電源插座等。透視窗由鋼化玻璃制成，可左右移動或上下移動。對于人工操作下柜采用實驗側桌式，下有桌面和柜體。小杯子和水龍頭可以安裝在桌面上。
實驗室通風柜由多種材料制成，如全鋼、鋼木、全木、鋁木、塑鋼、聚氯乙烯結構等。其桌面是與操作者直接接觸的地方，由固體物理和化學板、不銹鋼板、聚氯乙烯、陶瓷和其他材料組成。
實驗室通風柜大部分由木材制成，但現代通風柜大部分由涂有環氧樹脂的鋼制成普通櫥柜有1000、1200、1500、1800和2000毫米寬，700-900毫米深，1900-2400毫米高。1-3人同時使用
實驗室通風柜通常靠墻安裝。
前中間是一個透明的門（大部分是玻璃的），可以上下移動，開口高度一般為100-600毫米門后是實驗工作面，與水管、下水道、電源、真空泵、輸氣管道等實驗要求相連，由帶保護罩的燈具照明。空氣由機柜前部和頂部的排氣扇抽出后，可以通過管道引至另一個地方，或者經過過濾后再利用（稱為無管道通風）
大多數實驗室通風柜會在排氣量太小，聚丙烯實驗室通風柜前面的玻璃門開得太大時發出警報，提醒操作人員注意里面排氣扇和燈的速度可通過開關調節。使用時，一個人站在或坐在柜子前面，將玻璃門盡可能放低，通過門把手伸進柜子里進行實驗。由于排氣扇通過敞開的門向內排出空氣，在正常情況下，有害氣體不會大量溢出。
